仙剑奇侠传6的战斗系统采用了双战斗模式，兼顾即时制和回合制两种模式，并且这两种模式可以自由切换，玩家可以根据自己的喜好选择合适的战斗方式。
在战斗中，每个角色都有自己的时间槽，即使有人的时间槽先满了，其他人也不会停下来等待，这种设计让战斗节奏更加紧凑，需要玩家快速作出反应。此外，战斗中还有挑空、击落等设定，增加了战斗的多样性和策略性。
另外，游戏中还新增了“凝气一击”系统，玩家需要在战斗中不断积累“气”来发动这一系统。“凝气一击”共有三种模式，选择合适的时机使用往往可以在战斗中化险为夷，克敌制胜。
在遇敌方面，本作将“奇袭”升级，当玩家等级高于敌人一定程度时，可以在地图上用“奇袭”将敌人“一击秒杀”，直接获得经验、道具等奖励。这种设计让玩家在探索地图时更加刺激和有趣。
除此之外，游戏中的战斗形式也更加丰富，除了普通战斗形式外，还有“空中作战”、“射击模式”等特殊战斗形式，让玩家在战斗中能够体验到更多的乐趣和挑战。
在合击和QTE方面，游戏中继续沿用了前作的设定，不仅可以带来更高的伤害，还将带来更加多样的招式变化，让战斗更加华丽和刺激。
仙剑奇侠传6的战斗系统在保留传统回合制的基础上，融入了即时制战斗的元素，让战斗更加灵活和多样。同时，新增的系统和设定也让玩家在战斗中能够体验到更多的乐趣和挑战。
